现有中国少数民族语言文学和动物学2个国家重点学科，生态学国家重点培育学科；有1个一级学科自治区重点学科，18个二级学科自治区重点学科，8个自治区重点培育学科。蒙古学和生命科学两个学科群具有鲜明的民族特色和地区特色，在国内外享有盛誉。
内蒙古大学学科评估结果
| 专业名称 | 专业代码 | 专业评估 |
|---|---|---|
| 哲学 | 010101 | |
| 经济学 | 020101 | B |
| 金融学 | 020301K | B |
| 国际经济与贸易 | 020401 | B |
| 法学 | 030101K | B+ |
| 纪检监察 | 030108TK | |
| 政治学与行政学 | 030201 | B |
| 政治学、经济学与哲学 | 030205T | |
| 社会学 | 030301 | |
| 社会工作 | 030302 | B |
| 民族学 | 030401 | B+ |
| 马克思主义理论 | 030504T | |
| 运动训练 | 040202K | |
| 汉语言文学 | 050101 | A |
| 汉语国际教育 | 050103 | B+ |
| 中国少数民族语言文学 | 050104 | A+ |
| 古典文献学 | 050105 | |
| 英语 | 050201 | B+ |
| 俄语 | 050202 | B |
| 日语 | 050207 | B+ |
| 新闻学 | 050301 | B+ |
| 编辑出版学 | 050305 | B |
| 网络与新媒体 | 050306T | B+ |
| 历史学 | 060101 | B+ |
| 文物与博物馆学 | 060104 | B |
| 数学与应用数学 | 070101 | B+ |
| 信息与计算科学 | 070102 | B |
| 数理基础科学 | 070103T | |
| 物理学 | 070201 | B+ |
| 应用物理学 | 070202 | B |
| 化学 | 070301 | B+ |
| 应用化学 | 070302 | B |
| 大气科学 | 070601 | |
| 生物科学 | 071001 | B+ |
| 生物技术 | 071002 | B+ |
| 生态学 | 071004 | B |
| 统计学 | 071201 | |
| 机械工程 | 080201 | |
| 车辆工程 | 080207 | B |
| 材料化学 | 080403 | B |
| 电子科学与技术 | 080702 | B |
| 通信工程 | 080703 | B+ |
| 电子信息科学与技术 | 080714T | B |
| 自动化 | 080801 | B |
| 计算机科学与技术 | 080901 | B+ |
| 软件工程 | 080902 | B+ |
| 数据科学与大数据技术 | 080910T | B+ |
| 土木工程 | 081001 | B |
| 道路桥梁与渡河工程 | 081006T | B |
| 化学工程与工艺 | 081301 | B |
| 交通运输 | 081801 | B |
| 环境工程 | 082502 | B |
| 环境科学 | 082503 | B |
| 环境生态工程 | 082504 | B |
| 生物医学工程 | 082601 | |
| 食品科学与工程 | 082701 | B |
| 生物工程 | 083001 | B |
| 园艺 | 090102 | B |
| 信息管理与信息系统 | 120102 | B |
| 工程管理 | 120103 | B |
| 工商管理 | 120201K | B |
| 会计学 | 120203K | B |
| 行政管理 | 120402 | B |
| 劳动与社会保障 | 120403 | B |
| 土地资源管理 | 120404 | B |
| 物流管理 | 120601 | B |
| 旅游管理 | 120901K | B+ |
| 播音与主持艺术 | 130309 | B |
| 环境设计 | 130503 | B |
| 市政工程技术 | 440601 | |
| 汽车检测与维修技术 | 500211 | |
| 道路养护与管理 | 500206 | |
| 工程造价 | 440501 | |
| 道路与桥梁工程技术 | 500201 | |
| 智能工程机械运用技术 | 500203 | |
| 汽车技术服务与营销 | 500210 | |
| 现代物流管理 | 530802 |
