中药学（一级学科），方剂学，中医妇科学，中医内科学，针灸推拿学，中药创新药物学科群，中医学（一级学科），中西医结合（一级学科），中医基础理论，中医医史文献，中医临床基础，中医骨伤科学，生药学，中西医结合基础，中西医结合临床，中医内科心血管病学，中医消化病学，中医妇科学（针灸推拿学院）。
黑龙江中医药大学学科评估结果
| 专业名称 | 专业代码 | 专业评估 |
|---|---|---|
| 运动康复 | 040206T | B |
| 生物技术 | 071002 | |
| 应用心理学 | 071102 | B |
| 医学信息工程 | 080711T | |
| 制药工程 | 081302 | B |
| 食品科学与工程 | 082701 | |
| 中医学 | 100501K | B+ |
| 针灸推拿学 | 100502K | B+ |
| 中医康复学 | 100510TK | B |
| 中医骨伤科学 | 100513TK | |
| 中西医临床医学 | 100601K | B |
| 药学 | 100701 | B |
| 药物制剂 | 100702 | B+ |
| 药物分析 | 100705T | |
| 中药学 | 100801 | A |
| 中药资源与开发 | 100802 | B+ |
| 中药制药 | 100805T | B |
| 医学检验技术 | 101001 | |
| 医学实验技术 | 101002 | |
| 医学影像技术 | 101003 | |
| 康复治疗学 | 101005 | B |
| 智能医学工程 | 101011T | |
| 护理学 | 101101 | B |
| 助产学 | 101102T | B |
| 市场营销 | 120202 | B |
| 公共事业管理 | 120401 | B |
| 健康服务与管理 | 120410T | B+ |
