海军部队学院的专业设置如下：
海军指挥学院
海军战役指挥
海军合同战术指挥
海军师团政治工作
海军航空兵战术指挥
海军后勤指挥
海军参谋指挥
海军岸防兵战术指挥
海军陆战指挥
海军师资培训
海军航空兵学院
指挥专业（学制1年，分为上下两个学期，每学期6个月，包括领航、枪炮、鱼雷指挥、反潜作战、航道测量、飞行与控制、财会和物资管理以及文秘等）
海军航空兵专业（学制2年，第1年学习专业理论，第2年进行实际飞行训练）
海军后勤学院
后勤指挥（本科）
军港建筑工程（本科）
管理工程（本科）
油料储运工程（本科）
军队财务管理（本科）
军港管事（本科）
军需管理（本科）
军队财务管理（大专）
帆缆涂料管理（大专）
物资管理（大专）
海军士官学校
船舶与海洋工程
航海与导航技术
海洋工程与技术
军事通信与信息系统
机电一体化技术
海军潜艇学院
电子信息工程
水声工程
航海技术
救助与打捞工程
船舶与海洋工程
武器系统与工程
武器发射工程
这些专业涵盖了海军部队的各个方面，包括战役指挥、战术指挥、政治工作、后勤管理、航空兵战术、潜艇作战等，旨在培养具备专业知识和技能的海军军官。建议根据个人兴趣和职业规划，选择最合适的专业进行深入学习。
海军指挥学院学术成果
海军指挥学院在科学研究方面取得了丰硕成果，承担了多项国家级科研项目。
