云南在高等教育专业评价方面表现突出，根据软科发布的“2023软科中国大学专业排名”，云南省共有27所高校的572个专业上榜，其中昆明理工大学以96个专业上榜的成绩居全国第15名、全省首位，云南大学位居全省第二，有76个专业上榜，云南师范大学以66个专业上榜的成绩位居全省第三。
云南大学在多个专业上表现优异，例如法学、经济学、电子信息类、计算机类、数据科学与大数据技术、数学与应用数学、物理学、统计学等，这些专业在软科排名中均位于前列。云南师范大学也有多个专业获得A、B+、B等级，如航空服务艺术与管理、社会体育指导与管理、小学教育、体育教育、学前教育等。
云南省在顶尖专业的数量上同样表现出色，云南大学和云南警官学院均有3个A+专业，昆明理工大学、云南民族大学和云南艺术学院各有1个A+专业。云南省还有3个专业在全国排名第一，分别是昆明理工大学的汽车维修工程教育、云南警官学院的禁毒学和反恐警务，以及4个专业位列全国第二。
云南大学作为原211工程大学，入选“双一流大学”世界一流B类建设高校，在教育部第四轮学科评估中，民族学获得A等级，生态学获得A-，政治学、生物学、数学、化学等14个学科获得B级别评分。云南大学还拥有强大的师资力量，包括院士10人，国家杰出青年科学基金获得者15人等。
